
До образования первой Республики Армения молодёжь страны была вынуждена получать высшее образование в университетах России и Европы.
После восстановления государственности, руководство первой республики уделяло первостепенное внимание развитию духовной жизни страны, в частности - образовательному процессу.
Вопрос об открытии высшего учебного заведения в республике стал безотлагательным после закрытия частного вуз-а в Грузии, в котором получали образование многочисленные студенты из Армении.

В 1919-1920 гг. считалось первоочередным открытие историко-лингвистичекого факультета.
31-го января 1920-го года университет временно открывается в здании Александрапольской торговой школы, так как в Ереване отсутствовали необходимые условия. На торжественном открытии университета присутствовали премьер-министр Республики А. Хатисян, министр культуры и общественной науки Н. Агбалян, а также множество гостей как из Армении, так и из стран зарубежья. С нового учебного года университет был перемещен в здание Ереванской педагогической семинарии и назван Ереванским народным университетом, а с 1922 года – государственным университетом.
В эти годы Армения была в крайне тяжелых социально-экономических и санитарно-эпидемиологических условиях. Почти всё население было лишено возможности получать первую медицинскую помощь. В связи с этим целенаправленно осуществлялась работа по открытию медицинского факультета.
В конце октября 1920-го года премьер-министр Г. Оганджанян и министр народного образования Г. Казарян подписали постановление «О медицинском факультете в университете». Однако в силу политических обстоятельств данное постановление не было приведено в исполнение .

Декретом ревкома Республики от 22-го декабря 1920-го года был создан Наркомат здравоохранения. По решению последнего 3-го ноября 1921 года при Ереванской городской больнице была открыта школа подготовки медицинских кадров. Фактически, это было первое медицинское учебное заведение в Армении. Учебные программы школы соответствовали стандартам высшего образования. Тем не менее еще не было необходимых условий для обеспечения регулярного учебного процесса.

Первоначально учебной базой для медицинского факультета служил Анатомо-физиологический институт, находящийся в невзрачном здании, лишенном элементарных удобств. В данном здании были размещены кафедры нормальной анатомии, физиологии и гистологии. Кафедра патологической анатомии временно действовала в прозекторской второй городской больницы, а кафедра фармакологии – в одном из помещений Дома культуры городского совета.
В 1922-27 гг. формирование как теоретических, так и клинических кафедр было в основном завершено.

Отозвавшись на зов Родины, выдающиеся армянские врачи: профессора Амбардзум Кечек, Григор Медникян, Хачатур Архипянц, Овнан Габриелян, Арташес Мелик-Адамян, Андреас Арзуманян и другие пополнили ряды профессорско-преподавательского состава факультета. К 1930-му году их число достигло 102-х.
В 1930-ом году была отстроена часть биохимического корпуса, в котором разместились теоретические кафедры и администрация института.
В 1931-32 гг. было полностью сдано в эксплуатацию здание анатомикума, вместившее в своих стенах кафедры морфологии и судебной медицины.

Факультет послужил прочной платформой для организации здравоохранения и развития медицины.
По некоторым узким клиническим специальностям не было стационарных отделений, в которых студенты могли бы участвовать в диагностике, уходе и лечении больных. Самое большое хирургическое отделение с 28 койко-местами было в первой городской больнице. Ещё одной трудностью было то, что обучение велось на родном языке, в то время как учебников на армянском языке не было, а без наличия армянской медицинской терминологии перевести существующие на других языках учебники не представлялось возможным. В связи с этим выход в свет «Русско-латинско-армянского» медицинский словаря под редакцией В. Арцруни стало большим достижением. Словарь был издан в 1924-ом году и насчитывал порядка 19 тысяч лексических единиц.
В 1922-30 гг. для студентов медицинского университета было издано 17 учебников. Авторами первых учебников на армянском были В. Арцруни («Анатомия человека») и А. Акобян («Нормальна физиология человека»).
В 1927-ом году состоялся первый выпуск студентов высшего медицинского учебного заведения - 32 человека.
В первое время существования факультета прием студентов носил спонтанный характер. Это послужило причиной тому, что к 1930-му году он успел выпустисть лишь 136 врачей. И только начиная с 1930-1931 учебного года для уже самостоятельного медицинского института было выделено 150 учебных мест. Знаменательно то, что 30% студентов вуз-а состовляли граждане Грузии, Азербайджана, России и Ирана. До 1931-го года вуз имел лишь один факультет - медико-профилактический. В 1931-1932 учебном году открылся санитарно-гигиенический факультет, а в 1939-ом – русскоязычное отделение медицинско-профилактического факультета, так как учиться в институте приезжали армяне со всех стран СССР.
В 1936-ом году по решению Совнаркома СССР институту было предоставлено право принимать к защите кандидатские и докторские диссертации. Представители института и ранее защищали диссертации, получая звания кандидатов, а с 1944-го года – докторов медицинских наук, однако проходила защита в Москве, Ленинграде и других союзных городах.
Тяжелые последствия культа личности не обошли стороной и медицинский институт: в 1937-ом году группе именитых преподавателей и опытных руководителей были предъявлены безосновательные и мнимые обвинения. В результате махинаций преступной сталинской политики была прервана плодотворная деятельность таких специалистов, как Г. Мирза-Авагян, А. Ованнисян, С. Камсаракан, С. Багдасарян, А. Шахвердян.

Не успел институт оправиться от этого удара, как ему пришлось встретиться с новым испытанием. Разразилась Великая Отечественная война. Профессорско-преподавательский состав и студенты медицинского с честью выполняли свой долг перед Родиной, служа в рядах действующей армии и госпиталях тыла. В районах и городах Армении создаются многочисленный эвако-госпитали, основная часть врачей и руководителей которых были выпускники института. 56 из 85-ти научных работ, созданных в эти годы, были посвящены обороне. С начала войны университетские аудитории, лаборатории и клинические базы служили также медицинским институтам Краснодара и имени Орджоникидзе, переехевшим в Ереван. Начавшиеся в 1935-ом году периодические научные сессии, регулярно созывались и в военные годы. Особенно большое количество выпускников было именно в годы войны, в то время как начиная с 1927-го года, вузы Аремении дали всего 873 выпускника.
В 1947-ом году, для развития научно-исследовательской работы среди студентов и облегчения последующего выбора педагогических кадров, было создано студенческое научное общество. При кафедрах также формируются научные кружки.
В 1930-ом году была основана научная библиотека, а с 1958-года стала издаваться газета «Апага бжишк», по сей день освещающая жизнь вуза. В дальнейшем была также создана типография института, позволившая обеспечить кафедры необходимыми учебно-методическими материалами.
В 1957-ом году представителям армянской диаспоры была предоставлена возможность получить высшее медицинское образование на Родине, в связи с чем был открыт отдел иностранных студентов. Получить профессию врача в Ереване приезжали армяне из Сирии, Ливана, Иордании, Эфиопии, Ирана, Судана, Кипра, Болгарии, Венгрии, Франции, Великобритании и других стран.

Параллельно подготовке медицинских кадров институт занимался вопросами специализации и повышения квалификации уже практикующих врачей. Для предания данной работе фундаментальности и повышения профессиального уровня врачей всех медицинских заведений республики в 1958-ом году был открыт факультет усовершенствования врачей со своими кафедрами, на базе которой в 1963-ом году был основан Ереванский всесоюзный институт усовершенствования врачей (ныне Национальный институт здравоохранения): По решению Правительства РА в 2011-ом году образовательная составляющая последнего была объединена с образовательной системой медицинского университета с целью организации длительного процесса подготовки врачей в одном учебном заведении, оснащённом необходимыми кадровыми и структурными возможностями и клиническими базами.
В 1958-ом году, с целью подготовки квалифицированных педиаторов для республики, создаётся факультет педиатрии.
В 1961-ом был открыт факультет стоматологии со своими кафедрами, а в 1964-ом - научно-исследовательская лаборатория (с 1992-го года - научно-исследовательский центр).
В 1970-ом году в стенах института начинает действовать Университет искусства с двумя условными факультетами: музыки и изобразительных искусств. Данные направления искусства будущим врачам представляли видные деятели искусства и преподаватели консерватории.
В 1971-ом году Указом Президиума Верховного Совета СССР был утверждён текст «Присяги врача Советского Союза».
В 1972-ом году был основан фармакологический факультет, а в 1973-ем – факультет общественных специальностей. В 1975-ом году было создано подготовительное отделение, пройдя определённый курс в котором, люди, пришедшие с основного производства и демобилизованные солдаты Советской армии могли поступить в институт.

По решению Совета министров Армении от 25-го мая 1989-го года Ереванский государственный медицинский институт был назван в честь великого врача и мыслителя средневековья Мхитара Гераци.
Во время разрушительного землетрясения 1988-го года студенты и преподаватели с честью выполнили свой гражданский и профессиональный долг перед Родиной. Уже 7-го декабря в институте под руководством ректора был создан оперативный штаб. В тот же день порядка 200 студентов во главе со своими преподавателями уезжали в Спитак и Ленинакан оказывать перую медицинскую помощь пострадавшим. Каждый день в зону бедствия выезжали новые отряды из 200-250-ти человек. В институте создаётся пункт сдачи донорской крови, где за один день безвозмездно сдаёт кровь 400 человек. Студентки учредили круглосуточное дежурство в госпиталях Еревана, ухаживая за ранеными.
В 1991-ом году Армения была провозглашена независимой республикой. Помимо объективных трудностей, присущих переходному периоду, в 1992-1995-ые годы страна пережила глубокий экономический и энергетический кризис. Но даже в столь трудные времена, когда были парализованы не только экономика, транспорт, но и вся система образования, Ереванский государственный медицинский институт продолжает своё существование и даже переживает определенное развитие.
По требованию времени в 1992-ом году, когда Армения оказалась в положении войны, появляется необходимость в подготовке военных врачей. В 1994-ом году на базе созданной в 1992-ом году военной кафедры был открыт военно-медицинский факультет.
В 1992-ом году по инициативе студентов института был сформирован студенческий парламент, сыгравший важную роль в организации внутривузовской работы.
С 1997-го года университет инициировал процесс повышения квалификации преподавателей, поскольку после распада СССР сотрудники ЕГМУ не могли более повышать квалификацию в центральных городах Союза.

В 1999-2000-ом учебном году лечебный и педиатрический факультеты объединяются с факультетом медицинской профилактики в единый факультет общей медицины.
Медицинский достиг выдающихся успехов в установлении и развитии международных связей. Были достигнуты соглашения с медицинскими учрежденями Франции, Германии, Греции, Ирана и других стран. С каждым годом увеличивается число обменных программ для преподавателей, студентов и ординаторов.
Учитывая весомый вклад Ереванского медицинского института в деле подготовки медицинских кадров и развития медицины, в 1995-ом году по решению Правительства РА институту был присвоен статус университета. Для наилучшей организации подготовки врачей и постдипломного образования по решению Правительства РА №1940 от 15-го марта 1995-го года под юрисдикцию медицинского университета был полностью сдан прилагающий к нему больничный комплекс.
В 2010-ом году для подготовки квалифицированных врачей и фармакологов в университете был открыт факультет постдипломного и непрерывного образования.
На сегодняшний день университет насчитывает более 31-ой тысячи выпускников.
В 2011-2012-ом учебном году на 7-ми факультетах Ереванского государственного медицинского университета учится 5500 студентов, из них 1140 – представители зарубежных государств. Учебно-практическая и научно-исследовательская работа ведётся на 100 действующих кафедрах, ведущих клинических базах и научно-исследовательских центрах Еревана.
